Die Moxa-Therapie wirkt nach dem Prinzip der Gegenregulation. Der Körper reagiert hier folgend: bei Kälte zittern die Muskeln um die Durchblutung zu steigern und den Stoffwechsel zu aktivieren um mehr Wärme zu erzeugen. Bei Wärme beginnt der Körper zu schwitzen um die Wärme über die Verdünstung auszuleiten.
Bei der Gegenregulation wird durch Moxa in den Schweißdrüsen der Haut ein Stoff freigesetzt, der die Nervenenden anregt und dadurch eine Aktivierung der Hirnanhangdrüse und der Nebennieren auslöst, welche wiederum im Körper bestimmte Hormone freisetzen die ihre Wirkung auslösen.